Monokultur er praksis for plantning en enkelt afgrøde eller afgrøder er genetisk ens, i et bredt område. Fordelen, at landmændene er at planter kan dyrkes på betingelser tilpasset med succes og uden konkurrence fra andre arter. Imidlertid reducerer denne praksis også regionens biodiversitet ved at begrænse antallet af andre arter, der er et egnet levested. Videnskabsfolk advarede om, at åbningen af en stor skov til fordel for store vækst af afgrøder som sukkerrør at gøre biobrændstoffer skaber en monokultur skadelige for biodiversiteten. Modsat af monokultur er en polikultur.