Dr. Komyoji opretter Jiro (Kikaider), men en eksplosion sker. Når Dr Komyoji kids, Mitsuko og Masaru, deres far var ingen steder at finde. Jiro vandrer hovedløst i et fjernt område til sidst opfylder Mitsuko. Mitsuko underviser Jiro at gå ind i hans robot form og om GEMINI systemet inde i ham. To vokser tættere sammen, men forholdet udviklingen stopper når en mystisk fløjte spiller forårsager Jiro til at angribe Mitsuko, hvilket får hende til at tro, han er en gal maskine. Jiro efterlader uundgåeligt Mitsuko og Masaru i frygt for at blive ødelagt. Mitsuko derefter ansættelser Hanpei Hattori og hans lærlinge Etsuko Sarutobi for at finde Jiro og bringe ham hjem. i hele historien, Jiro støder på robotter og lærer mere om Professor Gill og onde organisationen mørke. En gentagne android navngivet Hakaider årsager Jiro styres af fløjte (svarende til Gills fløjte). Mere Mitsuko støder Jiro mere hun bliver forelsket med ham. , Når Mitsuko og Jiro genforenes, de søger efter Mistukos mor, der afslører for at være forelsket i professor Gill men ikke kunne bare smerte er væk fra hendes børn og giver dem placeringen til Professor Gills hovedkvarter højre før hun dræbte sig selv. Efter de opdager placering, Jiro forsøger at kæmpe Hakaider alene og også opdager hjernen inde Hakaiders hovedet, er Professor Komyoji. Professor Komyoji Forfatningsspørgsmål Hakaiders organ, før Hakaider kunne ødelægge det og infiltreret hovedkvarter. En gang Professor Gill opdager, Dr. Komyoji er i kontrol, han sender sin robotter til at angribe dem. Jiro var i stand til at give hjernen til Hanpei for at sætte det tilbage i Dr.Komyoji's organ. Professor Gill forsøg på at styre Jiro med sin fløjte, men Jiro til er i stand til at overvinde den. Hakaider derefter forsøger at dræbe Professor Gill for at forråde ham og ødelægger stedet og Gill. Hanpei, Mitsuko og Etsuko kunne undslippe, men ikke se Jiro escape med dem. Mitsuko har i sidste ende, håber, at Jiro vil vende tilbage til dem.